Recomendo que vá até a área java para mais detalhes , más já que vem ao caso irei lhe ajudar.
Navegue até o eclipse > Clique com o botão direito no projeto que deseja extrair a diff > navegue até a opção "Team" > Próximo ao topo vai ter "Create Patch" clique nele > Irá aparecer uma janela , lá no topo clique em Save in File System , vá até browser e escolha a pasta que deseja salvar, em seguida mais embaixo vai ter os arquivos modificados , selecione apenas os que você adicionou o mod > next e finish.
Por que precisamos da sua diff ? Para ver em qual método você adicionou o mod ._.